Dalam upaya menanamkan nilai budaya kerja untuk seluruh aparatur pemerintah di lingkungan SKPD Propinsi Jateng, RSUD Prof. Dr. Margono Soekarjo Purwokerto telah mengimplementasikan Kelompok Budaya Kerja (KBK) guna peningkatan produktifitas kerja yang profesional agar mutu pelayanan dapat ditingkatkan secara terus menerus dan berkesinambungan sehingga tercapainya pelayanan yang sesuai dengan harapan masyarakat. Dengan tujuan KBK itu sendiri yakni terciptanya identitas setiap organisasi, kestabilan organisasi, sebagai alat pendorong organisasi serta komitmen tiap-tiap organisasi agar terciptanya peningkatan produktifitas kerja yang profesional. Adapun bentuk KBK yang telah dibentuk yakni Kelompok Gugus Kendali Mutu (GKM) dan PSBH (Problem Solving for Better Hospital).